Здоров'я — один із трьох ключових орієнтирів цілісного освітнього процесу процесу в ліцеї. Стрижнем роботи ЧОПЛ як Школи сприяння здоров’ю є авторська загальнооздоровча система, розроблена і втілена в життя ліцею із 1994 року Віталієм Зозулею та його колегами: Іриною Мироненко, Євгенією Войстрик, Валерієм Пустовим.